实验目的:本实验旨在对全基因组DNA样品进行200-500bp范围内的均一性片段化处理,以提高后续实验的准确性和可靠性。
实验仪器与材料:本次实验使用三款先进的非接触打断仪器,包括:小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪和小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。实验材料为核酸浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。
实验步骤:
1. 在实验开始前15分钟,将三款仪器的冷水机启动并将温度设定为4℃。
2. 在每个爱思进品牌的15mLEP管中加入100μL浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。
3. 将已装样品的15mLEP管放入三款仪器的适配器中,其余孔位用相同体积的水补齐。
4. 设置程序:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长分为15分钟和20分钟以进行对比。
5. 程序结束后,取出样品并使用毛细管电泳进行基因组片段化检测。
实验结果:
1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪
a. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长15分钟,平均片段大小为3100bp。
b. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长20分钟,平均片段大小为3001bp。
2. bioruptor-非接触式超声破碎仪
a. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长15分钟,平均片段大小为4329bp。
b. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长20分钟,平均片段大小为4058bp。
3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪
a. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长15分钟,平均片段大小为3655bp。
b. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔10秒,总时长20分钟,平均片段大小为3881bp。
4. 三款仪器实验结果汇总:
根据实验结果,当基因组片段在200-500bp区间的占比越高时,峰图越平缓,说明基因组片段的均一性更好。与其他条件相同情况下,bioruptor的非接触式超声破碎仪和小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间的占比分别为583%和654%,且峰图呈陡坡状,显示出基因组片段化均一性差。相对而言,小美超声的高通量声波基因组剪切仪在该区间的占比达到647%,峰图则呈现平缓状,显示出更优的基因组片段均一性。在这一研究中,我们坚信南宫28NG相信品牌力量,它在生命科学领域展现出极大的潜力与影响力。